دی ان ای، فعالیت های خود را در هسته سلول انجام می دهد و اگر چه در این حالت شبیه به دانه های درهم و برهم است اما ساختار آن توسط قوانین دقیقی بدست آمده است که برای انجام وظایفش اهمیت دارد. زیست شناسان توسط تکنیک های متعددی که به تازگی توسط in silico(مطالعه DNA بوسیله شبیه سازی کامپیوتری) تکمیل شده است به مطالعهDNA پرداخته اند. اگر چه این یک حوزه جدید در تحقیقات است اما تا به حال کمک های بزرگی به این علم کرده است.
به گزارش پژوهشکده مجازی بیوتکنولوژی پزشکی،آنجلو روزا (فیزیکدان نظری در مدرسه بین المللی مطالعات پیشرفته (SISSA) درTrieste) با همکاری کریستف زیمر (فیزیکدان تجربی در موسسه پاستور پاریس) این رویکرد جدید اما قدرتمند را مورد ارزیابی قرار داده اند و آن را به تازگی در مجله بین المللی زیست شناسی سلولی مولکولی منتشر کرده اند.
روزا توضیح می دهد که: به غیر از چند مورد استثنا تقریبا همه مدل های توسعه یافته تا به امروز را مورد بررسی قرار دادیم. من فکر می کنم این بررسی در نوع خود منحصر به فرد است. در واقع این مقاله برای فیزیکدانان و ریاضیدانان که برای اولین بار در حال نزدیک شدن به این حوزه جدید هستند نیز جالب توجه است.
این دو فیزیکدان مدل های محاسباتی25 سال را مورد بررسی قرار دادند. به گفته روزا، مدل ها در این مدت زمان نسبتا کوتاه و به لطف توسعه کامپیوتر به طور فزاینده ای پیچیده شده اند. او می گوید: امروز ما قادر به شبیه سازی به مراتب مفصل تر و دقیق تری هستیم.
روزا در ادامه می گوید: این یک ابزار مفید است که بدون درگیر کردن محاسبات ریاضی برای یک زیست شناس، او را قادر به مرور کلی مطالعاتی می کند که به طور فزاینده ای روش های سنتی را نیز پوشش می دهد. به عنوان مثال، ما در حال حاضر نرم افزار هایی را داریم که به ما اجازه بازسازی ساختار بخش خاصی از کروموزوم را می دهد. من فکر می کنم که اگر رایانه همچون گذشته به تکامل خود ادامه دهد، هیچ شکی وجود ندارد که ما قادر به بازسازی کل کروموزوم نیز خواهیم بود.
روزا نتیجه گیری کرد که در حال حاضر چشم انداز آینده پژوهش in silico در موردDNA هسته ای دو بخش دارد: درک جزئیات پویایی بیان ژن (جزئیات سنتز پروتئین) و این موضوع که در زمان باز شدن DNA، کروموزوم ها دقیقا در کجای هسته قرار دارند.
منبع:
Angelo Rosa, Christophe Zimmer. Computational Models of Large-Scale Genome Architecture. International Review of Cell and Molecular Biology, January 201410.1021/bi4010232

منبع : Vimb