آناليز بيوانفورماتيكي حساسيت‌زايي پروتئينهاي جديد در موجودات تراريخته

[پیمان هادی فرکوش]

آناليز بيوانفورماتيكي حساسيت‌زايي پروتئينهاي جديد در موجودات تراريخته

نويسندگان: نجف الهياری فرد ، زرين مينوچهر

نوع مطالعه: مروری | موضوع مقاله: تخصصي

چکيده مقاله:

موجودات تراريخته اهميت، كاربرد و گستره وسيعي در زيست فناوري دارند. گياهان تراريخته در دهه اخير به منظور توليد مواد غذايي و مصارف صنعتي رشد و توسعه قابل توجهي داشته‌اند. چراكه استفاده از گياهان و محصولات تراريخته با توجه به محدوديتهاي افزايش سطح زير كشت، راه حلي كليدي پاسخ به تقاضاي روزافزون غذا در جهان است. از اينرو ايمني مصرف محصولات تراريخته يكي از ضروريات مهم به شمار مي رود. يكي از مهم‌ترين موارد ايمني، اطمينان از حساسيت‌زا نبودن (غير آلرژن) پروتئين‌هاي جديد در موجودات تراريخته است. آلرژي و آلرژن‌ها حدود يك سوم جمعيت جهان را تحت تاثير قرار داده‌اند. آلرژن پروتئين يا گليكوپروتئيني است كه بوسيله سيستم ايمني افراد داراي حساسيت شناسايي مي‌شود. تا كنون حدود 1600 آلرژن شناسايي شده‌اند. آناليزهاي بيوانفورماتيكي يكي از ابزارهاي كارآمد و اوليه براي تعيين آلرژنيسيته پروتئين‌هاي جديد به شمار مي آيند. اين كار بوسيله پايگاه‌هاي اطلاعاتي آلرژن‌ها با قابليت جستجو و محاسبه ميزان مشابهت توالي پروتئين جديد با پروتئينهاي آلرژن قبلي صورت مي‌گيرد. براساس مقررات بين‌المللي اين محاسبه مشابهت در سه سطح توالي كامل، توالي 80 اسيدآمينه‌اي (دامنه) و توالي 6 تا 8 اسيدآمينه‌اي انجام مي‌شود. درجه تاثير و سودمندي آناليزهاي بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته موجودات تراريخته جديد، ارتباط مستقيمي با ماهيت و محتواي پايگاه‌هاي اطلاعاتي دارد كه در تحليل از آن استفاده مي‌شود. اخيرا تعداد پايگاه‌هاي اطلاعاتي آلرژن‌ها افزايش يافته‌اند و هر كدام نيازهاي خاصي را برآورده مي‌سازند. اين پايگاه‌هاي اطلاعاتي در حجم داده‌ها، سازماندهي و قابليت‌ها تفاوت دارند. در اين مقاله ضمن معرفي اجمالي پايگاه‌هاي اطلاعاتي حاوي آلرژن‌ها، شامل IUIS ، AllAllergy، AFDS، a Allergome، InformAll، AllergoPharma، SDAP، EVALLER،ALLERDB ، Biopep آناليز بيوانفورماتيكي توالي‌هاي پروتئيني به منظور بررسي آلرژنيسيته با استفاده از اين پايگاه‌ها نيز تبيين گرديده است. كلمات كليدي: آناليز In Silico، ارزيابي آلرژنيسيته، آلرژن‌ها، موجودات تراريخته (GMOs)

واژه‌هاي كليدي:

متن كامل [PDF 362 kb]