pourbehesht
20th October 2014, 06:18 PM
ساختارهای Cas9
http://vimb.ir/content/news/875/875l.jpg آیا داشتن ساختار های مولکولی محدودالاثر Cas9 توانایی ما برای ویرایش ژنوم را افزایش می دهد؟
در پروکاریوتها مصونیت از مهاجمان از طریق خوشه های تکرار های پالیندرومی کوتاه با فاصله منظم (CRISPR) بوجود می آید. این سیستم ایمنی منحصر به فرد با استفاده از RNA های کوچک و با شناسایی و از بین بردن DNA ویروس از سلول ها محافظت می کند. سیستم به حدی موثر است که محققان آندونوکلئاز های Cas9 مرتبط با CRISPR را برای مقاصد ویرایش ژنوم ربوده اند.
http://vimb.ir/content/upload/841199e7-47b6-4298-baab-697fc2a15abe.jpg
ساختارهای SpyCas9 و AnaCas9
به گزارش پژوهشکده مجازی بیوتکنولوژی پزشکی و به گفته Jennifer Doudna (یک زیست شناس مولکولی دانشگاه کالیفرنیا در برکلی که از محققین سیستم CRISPR/Cas نبوده است) پروتئین های Cas9 با برش ژنوم می توانند تغییرات کووالانسی را ارائه و اطلاعات جدیدی را بوجود آورند. دو نوع عمده از پروتئین های Cas9 که در زیست شناسی رخ می دهد، اندازه های متفاوت و کاملا مجزا در سطح توالی دارند. ما بسیار علاقه مند هستیم که بفهمیم آنها چه نوع از ساختارهای مولکولی را می توانند تشکیل دهند، آنها چگونه با هم در ارتباطند و چگونه آنها با پروتئین های دیگر میانکنش دارند. و با استفاده از این اطلاعات چگونه ما قادر خواهیم بود که به طور بالقوه این پروتئین ها را برای انجام کارهای دیگر مهندسی کنیم.
Doudna و همکارانش از کریستالوگرافی اشعه X استفاده کردند تا به بررسی نزدیک ساختارهای دو آنزیم Cas9 (SpyCas9 و AnaCas9) بپردازند. Doudna می گوید: ایده ما این بود که به احتمال زیاد تفاوت در ساختار سه بعدی این پروتئین ها بواسطه توالی پلی پپتیدی شان است. اما آنچه واقعا جالب بود نحوه تفاوت آنها از یکدیگر به چه شکل می باشد. واضح است که تکامل با روش های مختلفی از سازماندهی این حوزه (از قبیل این که این پروتئین ها در واقع در سطح ساختاری از یکدیگر متفاوت هستند) بوجود می آید. این واقعیت که این حوزه های کاملا محافظت شده بطور متفاوتی سازماندهی شده اند، جنبه هایی را روشن می سازد که ما نمی توانیم بدون در دسترس بودن این مدل های سه بعدی تصور کنیم. منبع:
Jinek M, Jiang F, Taylor DW, Sternberg SH, Kaya E, Ma E, Anders C, Hauer M, Zhou K, Lin S, Kaplan M, Iavarone AT, Charpentier E, Nogales E, Doudna JA. Structures of Cas9 endonucleases reveal RNA-mediated conformational activation. Science 14 March 2014: Vol. 343 no. 6176 1247997
منبع : vimb
http://vimb.ir/content/news/875/875l.jpg آیا داشتن ساختار های مولکولی محدودالاثر Cas9 توانایی ما برای ویرایش ژنوم را افزایش می دهد؟
در پروکاریوتها مصونیت از مهاجمان از طریق خوشه های تکرار های پالیندرومی کوتاه با فاصله منظم (CRISPR) بوجود می آید. این سیستم ایمنی منحصر به فرد با استفاده از RNA های کوچک و با شناسایی و از بین بردن DNA ویروس از سلول ها محافظت می کند. سیستم به حدی موثر است که محققان آندونوکلئاز های Cas9 مرتبط با CRISPR را برای مقاصد ویرایش ژنوم ربوده اند.
http://vimb.ir/content/upload/841199e7-47b6-4298-baab-697fc2a15abe.jpg
ساختارهای SpyCas9 و AnaCas9
به گزارش پژوهشکده مجازی بیوتکنولوژی پزشکی و به گفته Jennifer Doudna (یک زیست شناس مولکولی دانشگاه کالیفرنیا در برکلی که از محققین سیستم CRISPR/Cas نبوده است) پروتئین های Cas9 با برش ژنوم می توانند تغییرات کووالانسی را ارائه و اطلاعات جدیدی را بوجود آورند. دو نوع عمده از پروتئین های Cas9 که در زیست شناسی رخ می دهد، اندازه های متفاوت و کاملا مجزا در سطح توالی دارند. ما بسیار علاقه مند هستیم که بفهمیم آنها چه نوع از ساختارهای مولکولی را می توانند تشکیل دهند، آنها چگونه با هم در ارتباطند و چگونه آنها با پروتئین های دیگر میانکنش دارند. و با استفاده از این اطلاعات چگونه ما قادر خواهیم بود که به طور بالقوه این پروتئین ها را برای انجام کارهای دیگر مهندسی کنیم.
Doudna و همکارانش از کریستالوگرافی اشعه X استفاده کردند تا به بررسی نزدیک ساختارهای دو آنزیم Cas9 (SpyCas9 و AnaCas9) بپردازند. Doudna می گوید: ایده ما این بود که به احتمال زیاد تفاوت در ساختار سه بعدی این پروتئین ها بواسطه توالی پلی پپتیدی شان است. اما آنچه واقعا جالب بود نحوه تفاوت آنها از یکدیگر به چه شکل می باشد. واضح است که تکامل با روش های مختلفی از سازماندهی این حوزه (از قبیل این که این پروتئین ها در واقع در سطح ساختاری از یکدیگر متفاوت هستند) بوجود می آید. این واقعیت که این حوزه های کاملا محافظت شده بطور متفاوتی سازماندهی شده اند، جنبه هایی را روشن می سازد که ما نمی توانیم بدون در دسترس بودن این مدل های سه بعدی تصور کنیم. منبع:
Jinek M, Jiang F, Taylor DW, Sternberg SH, Kaya E, Ma E, Anders C, Hauer M, Zhou K, Lin S, Kaplan M, Iavarone AT, Charpentier E, Nogales E, Doudna JA. Structures of Cas9 endonucleases reveal RNA-mediated conformational activation. Science 14 March 2014: Vol. 343 no. 6176 1247997
منبع : vimb